美國(guó)FBI探員福克斯·穆德（大衛(wèi)·杜楚尼DavidDuchovny飾）童年時(shí)曾經(jīng)歷一起離奇神秘的綁架案，他的妹妹薩曼莎在睡夢(mèng)中被外星人劫持，至今下落不明。從此穆德便專注于神秘事件的研究，并專門(mén)負(fù)責(zé)FBI總部的X檔案部門(mén)。因穆德行事乖張，難以駕馭。FBI高層從聯(lián)邦調(diào)查局學(xué)院調(diào)來(lái)女性探員黛娜·斯科莉（吉蓮·安德森GillianAnderson飾），表面上是協(xié)助穆德工作，實(shí)際上是希望這名崇尚科學(xué)的理性探員能夠制約穆德的行為。兩人最初的合作并不理想，完全不同的思維模式時(shí)刻導(dǎo)致?tīng)?zhēng)論的爆發(fā)。但隨著各種離奇案件的出現(xiàn)以及兩人交往的加深，穆德和斯科莉最終變成可以為對(duì)方出生入死的可靠伙伴……本片榮獲1996~1999年度美國(guó)作曲家、作家及出版商協(xié)會(huì)影視音樂(lè)獎(jiǎng)電視劇集第一名以及其他電影節(jié)近70個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng)。